开始以急性腹痛为主，呈阵发性绞痛或持续性痛伴阵发加重，痛多在脐周或遍及全腹。随之有腹泻，多数为血水样或果酱样血便，偶有紫黑色血便，也有少数患者腹痛不明显而以血便为主要症状。半数患者伴有恶心、呕吐，有些患者在入院时己呈中毒性休克状。患者有中等度发热(37~39度)，可有寒战。腹部检查可见程度不同的腹胀、腹肌紧张及压痛，当肠管坏死或穿孔时，可有明显的腹膜炎征象，有时可触及充血水肿增厚的肠袢所形成的包块。肠鸣音一般减弱或消失。
根据患者不同的病变程度与病情发展的速度，临床上可归纳为4型：
1、血便型：以便血为主要症状，也可以有腹痛、发热、腹泻等症状。出血量多少不一，少者仅为便中带血，多者每日达数百毫升，腹部有轻压痛而无明显的腹膜刺激征。需与肠套叠、绞窄性肠梗阻，肠过敏性紫瘢等相鉴别。
2、中毒型：起病时即有高热，腹痛、腹泻，继之有嗜睡、谵妄、昏迷和休克等表现，休克多在发病1~2天内发生，在小儿多见，易误诊为中毒性疾病或消化不良。
3、腹膜炎型：较为常见，约有半数病例属于此型，表现为腹痛、呕吐、发热，也有腹泻和血便，腹部表现有局限性或弥漫性腹膜炎的征象，腹腔内有积液，肠鸣音减弱，重者可出现休克。
4、肠梗阻型：与一般机械性肠梗阻相似，主诉以阵发性腹绞痛和频繁呕吐为主，常有腹泻，偶有少量血便，腹部可见膨胀偶有肠型，这一类型较为少见。
术前确诊有时较为困难，在多发地区高发季节，易考虑到这一疾病。误诊率甚高，常误诊为肠套叠、细菌性痢疾、急性阑尾炎。在剧烈腹痛、腹泻、血便与中毒症状均存在时应多考虑本病。X线腹部平片显示小肠扩张积气，空肠黏膜皱襞粗糙，肠间隙增宽，立位片可见液平面，肠段坏死时则示不规则的致密阴影团。腹腔穿刺液可能为血性。化验检查可见白细胞计数中度升高，有血便或大便隐血阳性。
